药方的组织原则是为了使药方更好地产生治疗效果，使各药都能尽量发挥作用。并利用药物相互间的互助、相畏、相须、相使等作用，辅助不足、监制太过，以增强药方的治疗作用。因而，在组织药方时，方中的药物不是简单地、平均地拼集起来的，而是根据治法的要求和具体情况的需要各有侧重与主次轻重等区别。一般说药方中的药物要有主药、辅药、佐药、使药等不同。

（1）主药：针对病情或病因，治疗主证，解决主要矛盾，药力使用最充足的叫主药。

（2）辅药：辅助主药或监制主药，使主药更好地发挥治疗作用的叫辅药。

（3）佐药：治疗兼证或为了使主药、辅药更好地发挥药力而予以创造有利条件，给主药、辅药增强效力的叫佐药。

（4）使药：引导药力直达病位，或引药上升、下降、达表、入里，或协调诸药，或矫味、赋形的叫使药。

另外，还有在热药中少加一些寒药，或在寒药中少加一些热药，以利治疗作用的叫做反佐药。反佐药在一般情况下不常用。

以上是组织药方的一般原则。举例来说，如麻黄汤（麻黄、桂枝、杏仁、甘草）是治疗伤寒太阳病、表实证（头痛、恶寒、发热、无汗、气喘、全身肢体酸痛、脉浮紧等）的主要方剂。方中用麻黄辛温发汗、解表散寒为主药；桂枝辛温通阳，增强麻黄的发汗、散寒作用为辅药；杏仁苦平利肺气而治兼症的气喘，同时杏仁苦降又能防止主药的辛散太过为佐药；甘草甘缓和中、协调诸药为使药。四药配合，共达辛温发汗，散表解寒的作用。

上述例子只是就一般组织情况而言，如果遇到病情复杂或病情严重的，也可用两味或三味主药，二至四味辅药，三至五味佐使药，甚或六至七味佐使药等等；但也有时用一味主药，二、三味辅药组成药方；也有的不用辅药，只用主药和二、三味佐使药组成，甚至也可只用主药，和使药组成药方。就是说不一定每张药方都要具备主药、辅药、佐药、使药以及反佐药等等，主要是根据治法的要求和具体情况需要而定，不可刻板拘泥。